کمیته‌های بیمارستانی گروه‌هایی متشکل از متخصصان و کارکنان مختلف در بیمارستان هستند که برای بهبود کیفیت خدمات درمانی و مدیریت بهتر بیمارستان تشکیل می‌شوند. این کمیته‌ها در حوزه‌های مختلفی مانند اخلاق پزشکی، مدیریت خطر، ایمنی بیمار، کیفیت غذا و… فعالیت می‌کنند. هر کمیته وظایف و مسئولیت‌های مشخصی دارد و با برگزاری جلسات منظم، بررسی مشکلات و ارائه راهکارها، به بهبود عملکرد بیمارستان کمک می‌کند. هدف اصلی کمیته‌های بیمارستانی در بیمارستان موسی بن جعفر (ع) قوچان، افزایش رضایت بیماران، ارتقای کیفیت خدمات درمانی و ایجاد محیطی امن و سالم برای بیماران و کارکنان است.